全基因組關聯研究鑒定了數千種與人類疾病風險相關的變異位點。然而，目前在稀有和低頻位點的關聯分析研究仍然不足，并且很難追蹤到疾病具體的因果機制。
近日，一個由美國和英國研究小組組成的研究團隊在《Nature》雜志上發表題為“Genetic associations of protein-coding variants in human disease”的文章，通過對英國生物樣本銀行(UKB)以及芬蘭基因庫(FG)兩大基因組數據庫的分析，揭示了罕見變異與疾病之間的關聯，為細致的致病性分析提供依據。
研究團隊整合UKB與FG兩大全外顯子組測序數據庫（總共 653,219 名個體），對 744 種疾病表型進行關聯薈萃分析，由此確定了975個基因遺傳變異與疾病之間的關聯，其中有超過三分之一先前未見報道，兩個生物庫的并行研究極大地擴展了對罕見基因以及相關疾病的研究靈敏度。將關聯位點映射到基因后，發現有482個基因與148個疾病簇相關。482個基因中，13個基因座與至少5個疾病簇相關，說明這些基因存在基因多效性，例如CHEK2基因，除了被報道與乳腺癌相關外，在本研究中還發現與結直腸癌、甲狀腺癌、子宮平滑肌瘤、良性腦膜腫瘤和卵巢囊腫的發生風險均相關。研究團隊針對發現的基因遺傳變異對一系列不同的基因和信號途徑進行了生物學研究，發現兩個血凝蛋白的罕見遺傳變體與肺栓塞相關。此外，該研究團隊還發現一些多效性疾病位點，這些位點的發現為多種疾病提供了生物學標記物，可以用于臨床診斷以及藥物開發。
該研究基于兩個大規模數據庫的分析，報告了大量新的疾病關聯基因遺傳變異，彌補了罕見以及低頻率等位基因頻譜與疾病發生的關聯。
論文鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41586-022-04394-w
注：此研究成果摘自《Nature》雜志，文章內容不代表本網站觀點和立場，僅供參考。
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